Svineinfluenza har kun halve genetiske markører set i tidligere pandemiske stammer


Svineinfluenza har kun halve genetiske markører set i tidligere pandemiske stammer

Den nye H1N1 "svineinfluenza" stamme, der spredes over hele verden og er næsten på pandemisk alarmniveau, har kun halvdelen af ​​de vigtigste genetiske markører fundet i tidligere pandemiske stammer, sagde amerikanske forskere i går.

Jonathan Allen og Tom Slezak fra Lawrence Livermore National Laboratory, et US Department of Energy Lab i Livermore, Californien, og kolleger, offentliggjorde en undersøgelse i open access journal BMC mikrobiologi 2 uger siden beskrev hvordan de fandt 34 konserverede aminosyremarkører fra tidligere pandemiske influenzestammer.

Siden da har de analyseret sekvenser fra den nye H1N1-virus og fundet, at den kun har halvdelen af ​​de 34 markører.

Dog forsynede Slezak med, at mens deres konstatering tyder på, at den nuværende H1N1-stamme mangler mange af de attributter, der gjorde tidligere udbrud dødelig, betyder manglen på lighed med disse stammer ikke, at det ikke vil være et stort problem.

Allen og Sleazak sagde også, at der var behov for mere forskning, før vi kunne sige, hvor farlig den nye belastning faktisk kunne være.

I deres oprindelige undersøgelse anvendte Allen og Sleazak og kolleger omvendte ingeniørprincipper for at søge klassespecifikke aminosyre mutationer konserveret i tidligere pandemier.

For at gøre dette brugte de "proteomer" fra tidligere pandemiske virusstammer: et preteom er hele samlingen af ​​aminosyrer, der er lavet, når alle gener i en organisme udtrykkes. Så i virkeligheden, hvad de gjorde, scannede alle byggestenene af proteiner, at alle gener af tidligere pandemiske stammer udtrykte og så efter gentagne mønstre over stammerne.

De fandt 34 aminosyre markører, der var forbundet med værtsspecificitet og høj dødelighed. Nogle af markørerne betød lidt alene, men i kombination med "andre mutationer forbedrede de klasseprognoser", fandt de.

"Evolutionære veje, der involverer H1N1-humane og svinestammer blandet med fuglestammer, viser potentialet til at erhverve pandemicmarkørerne med dobbeltfordeling og en eller to aminosyre-mutationer," skrev de.

Resultaterne kan have vigtige konsekvenser for, hvordan overvågningsværktøjer kunne spore nye mutationer mere effektivt og illustrere "potentialet for genforvridning og mutationshændelser, der fører til nye cirkulerende influenzastammer", sagde Allen og Sleazak.

"Konserverede aminosyre markører fra tidligere influenzapandemiske stammer."

Jonathan E Allen, Shea N Gardner, Elizabeth A Vitalis og Tom R Slezak.

BMC Microbiology2009, 9:77

Udgivet: 22. april 2009

doi: 10,1186 / 1471-2180-9-77

Yderligere kilde: Biomed Central.

"Marching To Zion" Full Movie With Subtitles (Video Medicinsk Og Professionel 2021).

Afsnit Spørgsmål På Medicin: Sygdom